Jeżeli pracodawca wypowiedział umowę przed doręczeniem pracownikowi karty powołania do służby przygotowawczej, a okres wypowiedzenia upływa po dniu doręczenia tej karty, wypowiedzenie staje się bezskuteczne. W tym przypadku rozwiązanie stosunku pracy może nastąpić tylko na żądanie pracownika. Przykładowo, zatrudniony na czas nieokreślony 30 marca 2016 r. otrzymał wypowiedzenie umowy o pracę z zachowaniem trzymiesięcznego okresu wypowiedzenia. Umowa powinna rozwiązać się 30 czerwca 2016 r., ale 20 kwietnia pracownik otrzymał kartę powołania do służby przygotowawczej. O powołaniu do jej odbycia od 10 maja WKU powiadomiła też pracodawcę. W tej sytuacji wypowiedzenie jest bezskuteczne, chyba że pracownik zażąda rozwiązania stosunku pracy.
Jeżeli powołany do służby przygotowawczej jest zatrudniony na podstawie umowy na okres próbny, a upływ okresu próbnego przypada po powołaniu go do służby przygotowawczej, umowę uważa się za zawartą na czas nieokreślony (art. 118 ust. 3 ustawy). Natomiast umowa o pracę zawarta na czas określony rozwiązuje się z upływem terminu określonego w umowie (art. 118 ust. 5 ustawy).
Pracownik w ciągu 30 dni od zwolnienia ze służby powinien zgłosić się w celu podjęcia pracy do zakładu, który zatrudniał go w dniu powołania do służby przygotowawczej. Pracodawca, który angażował pracownika w dniu powołania do służby przygotowawczej, musi go przyjąć na poprzednio zajmowane stanowisko lub na równorzędne pod względem rodzaju pracy oraz wynagrodzenia. Jeśli pracownik nie zachowa terminu 30 dni na powrót, jego stosunek pracy wygasa, chyba że opóźnienie nastąpiło z przyczyn usprawiedliwiających nieobecność w pracy (art. 122 ust. 1 ustawy).
Na czas trwania służby szef udziela pracownikowi urlopu bezpłatnego oraz zgodnie z art. 125 ustawy wypłaca odprawę w wysokości dwutygodniowego wynagrodzenia obliczonego według zasad określonych do ustalania ekwiwalentu za urlop wypoczynkowy. Stanowisko w tej sprawie zajął Główny Inspektorat Pracy (GPP-459-4560-11-1/11/PE/RP). Wskazał, że „(...) mając na uwadze treść art. 133 ustawy, który gwarantuje żołnierzom pełniącym służbę przygotowawczą oraz członkom ich rodzin szczególne uprawnienia przewidziane dla żołnierzy zasadniczej służby wojskowej i członków ich rodzin na zasadach określonych w art. 118–132, nie można odmówić pracownikowi powołanemu po raz pierwszy do służby przygotowawczej prawa do odprawy. Oznacza to, że art. 125 ustawy ma zastosowanie w takim samym zakresie do pracownika powołanego do służby przygotowawczej na podstawie dobrowolnego zgłoszenia się do tej służby, jak i do pracownika, który ochotniczo zgłosił się do odbycia zasadniczej służby wojskowej zgodnie z art. 83 ust. 1 lub 2 ustawy".
Z pisma GIP wynika, że pracownikowi powołanemu po raz pierwszy do służby przygotowawczej przysługuje odprawa w wysokości dwutygodniowego wynagrodzenia obliczonego według zasad określonych dla ekwiwalentu urlopowego. W czasie urlopu bezpłatnego etatowiec zachowuje wszystkie uprawnienia wynikające ze stosunku pracy, z wyjątkiem prawa do wynagrodzenia (art. 124 ustawy).
Na wniosek pracownika, któremu doręczono kartę powołania do służby przygotowawczej, pracodawca musi udzielić dwóch dni zwolnienia od pracy. Za czas tego zwolnienia nie przysługuje mu jednak prawo do wynagrodzenia.