Podczas gdy Straż Akademicka broniła dobytku przed szabrownikami, przybyły do Wrocławia prof. Ludwik Hirszfeld, zasłużony polski immunolog, organizował pierwszą obsadę akademicką Wydziału Lekarskiego. W jej skład weszło wielu lekarzy ze środowiska lwowskiego, głównie z Uniwersytetu Jana Kazimierza. Za oficjalny termin utworzenia Akademii Medycznej we Wrocławiu (pierwotnie zwanej Akademią Lekarską) uznaje się 1 stycznia 1950 roku. Pierwszym jej rektorem został prof. Zygmunt Albert. Patronat Piastów Śląskich uczelnia zyskała 23 listopada 1989 roku.

Przez 60 lat działalności wrocławska Akademia Medyczna urosła do rangi jednej z najbardziej renomowanych polskich uczelni. W zeszłorocznym rankingu „Rz” zajęła pierwsze miejsce pod względem warunków studiowania i utrzymała pozycję lidera pod względem liczby publikacji – w kryterium siła naukowa. Akademia, w ramach której działają dwa szpitale kliniczne, jest największym ośrodkiem specjalistycznego leczenia chorych z Dolnego Śląska, Opolszczyzny i ziemi lubuskiej. W 1958 roku prof. Wiktor Bross wykonał tutaj pierwszą w Polsce operację na otwartym sercu, a w 1966 roku pierwszy przeszczep nerki od żywego dawcy. Akademia stała się też liderem w dziedzinie operacji wytwórczych przełyku.

W 2000 roku na uczelni tej powołano Wydział Lekarsko-Stomatologiczny, który obecnie jest jednym z trzech samodzielnych wydziałów stomatologicznych w Polsce. Trzy lata później na Wydziale Lekarskim powstał Zespół ds. Nauczania w Języku Angielskim, kształcący studentów z zagranicy.

Największą inwestycją uczelni jest budowa Centrum Klinicznego obejmującego dziewięć obiektów przeznaczonych na potrzeby Akademickiego Szpitala Klinicznego im. Jana Mikulicza-Radeckiego. Zakończenie tej inwestycji jest planowane na marzec 2011 roku. W 2010 roku Akademia rozpoczęła również budowę jednego z największych i najnowocześniejszych w Europie kompleksów medyczno-naukowych: Zintegrowanego Centrum Edukacji i Innowacji Wydziału Farmaceutycznego.