W punkcie drugim Trybunał orzekł, że Sąd Najwyższy nie ma kompetencji do sprawowania kontroli ze skutkiem prawnym wykonywania kompetencji prezydenta Rzeczypospolitej Polskiej w zakresie prawa łaski.
Orzeczenie zapadło większością głosów. Zdanie odrębne zgłosili sędziowie: Piotr Pszczółkowski i Michał Warciński.
Przedmiotem sporu kompetencyjnego było pytanie:
1) jaki charakter ma kompetencja, o której mowa w art. 139 w związku z art. 144 ust. 3 pkt 18 Konstytucji:
a) czy jest to uprawnienie Prezydenta RP, które wykonuje on osobiście i bez ingerencji innych podmiotów;