Podatnik wniósł skargę na otrzymaną interpretację do WSA. Sąd zgodził się ze stanowiskiem podatnika i zaskarżoną interpretację uchylił. WSA stwierdził, że podatnik nie musi prowadzić ewidencji cały rok. Wystarczy, że wykaże odpowiednią ewidencję przy rozliczeniu z właściwym organem. W wielu innych przepisach ustawodawca bezpośrednio wskazuje bowiem na obowiązek całorocznej i ciągłej ewidencji, gdy uznaje to za konieczność. Nie ma to jednak miejsca w przypadku ulgi IP BOX. Z tego względu należy uznać, że brak tego obowiązku został przez ustawodawcę wprowadzony celowo.
Pascal Purcel - współpracownik zespołu zarządzania wiedzą podatkową firmy Deloitte
Adrian Jasiński - starszy konsultant w dziale doradztwa podatkowego Deloitte
Obowiązująca już od prawie dwóch lat regulacja dotycząca preferencyjnego opodatkowania dochodów uzyskanych przed podatników z wytworzonych praw własności intelektualnej, zwana ulgą IP Box, wciąż przysparza trudności dotyczących właściwej interpretacji wymogów uprawniających do skorzystania ulgi. Zdarza się również, że – tak jak w opisanym przypadku – dyrektor KIS dokonuje błędnej wykładni przepisów, co może skutkować brakiem możliwości skorzystania z ulgi, pomimo, że jak się wydaje, podatnik spełnienia warunki przewidziane w ustawie o PIT.
Co do zasady podatnik może skorzystać z preferencyjnego opodatkowania wyłącznie w zeznaniu za rok podatkowy, w którym osiągnięto kwalifikowany dochód. Wyłączona jest więc możliwość skorzystania z ulgi na etapie kalkulowania zaliczek miesięcznych w trakcie roku podatkowego. Wyjątek od tego wprowadziła jednak tarcza antykryzysowa, która stanowi, że podatnicy osiągający w 2020 r. kwalifikowane dochody z kwalifikowanych praw własności intelektualnej (od 1 marca 2020 r.), które wykorzystywane są do przeciwdziałania Covid-19, mogą stosować w trakcie roku podatkowego do opodatkowania tych dochodów stawkę podatku, o której mowa w tym przepisie, przy obliczaniu zaliczek na podatek dochodowy.
Poza tym wyjątkiem, w trakcie roku podatkowego podatnik oblicza zaliczki na podatek dochodowy na zasadach ogólnych, przewidzianych w ustawie o PIT lub ustawie o CIT. Następnie dopiero w zeznaniu rocznym wykazuje podatek należny, stosując 5-proc. stawkę do dochodu z kwalifikowanych IP i w konsekwencji może liczyć na zwrot nadpłaconego w trakcie roku podatku.
Ani w ustawie o PIT, ani w ustawie o CIT nie wskazano jednak obowiązku prowadzenia na bieżąco ewidencji podatkowej w celu skorzystania z ulgi IP Box. Ustawa stanowi jedynie, że podatnicy prowadzący podatkową księgę przychodów i rozchodów (a taki uproszczony sposób ewidencji księgowej wybrał wnioskodawca), wykazują wymagane przepisami ustawy informacje w odrębnej ewidencji. Ustawodawca nie określił tym samym ani formy prowadzenia takiej ewidencji, ani czasu jej przygotowania. Dyrektor KIS, jako proponowane rozwiązanie dotyczące prowadzenia ewidencji, przytoczył w wydanej interpretacji fragment objaśnień podatkowych z 15 lipca 2019 r., dotyczących preferencyjnego opodatkowania dochodów wytwarzanych przez prawa własności intelektualnej – IP Box, w których mowa jest o „sporządzaniu techniką komputerową w postaci arkusza kalkulacyjnego kumulatywnego, comiesięcznego zestawienia dokumentów, które potwierdzają poniesione wydatki dotyczące projektu kwalifikowanego IP na koniec danego miesiąca". Jak słusznie jednak stwierdził sąd, objaśnienia ministra finansów nie mają waloru normatywnego. Tym samym nie mogą nakładać na podatników obowiązków, które nie wynikają z przepisów prawa.
