Większość senatarów nie poparła ustawy z przyjętymi zmianami, aprobaty nie uzyskały także wniosku o odrzucenie ustawy oraz jej przyjęcia bez poprawek. Wobec powyższego Marszałek Senatu, Tomasz Grodzki skierował ją do ponownego rozpatrzenia podczas połączonych prac Komisji Nauki, Edukacji i Sportu, Praw Człowieka, Praworządności i Petycji, Rodziny, Polityki Senioralnej i Społecznej, Samorządu Terytorialnego i Administracji Państwowej oraz Zdrowia.
Największe kontrowersje w Senacie wywołała poprawka nr 63a, która dotyczyć miała wykreślenia z ustawy przepisów depenalizujących złamanie dyscypliny finansów publicznych w czasie wojny przez urzędników. Wątpliwości w głównej mierze nie dotyczyły jej treści merytorycznej, a kwestii tego, że poprawka taka nie była zgłoszona podczas wspólnych obrad komisji i miała zdaniem niektórych zostać dopisana.