Przepisy dają na to czas do końca 2010 r. Zmiany w systemie jednostek sektora finansów publicznych nie mają jednak na celu likwidacji samej działalności tych gospodarstw. Dlatego samorządy prowadzące szkoły powinny przekształcić warsztaty szkolne dotychczas działające jako gospodarstwa pomocnicze w jednostki budżetowe prowadzące taką samą działalność oświatową – przypomina Ministerstwo Edukacji Narodowej. Należy zastosować do tego § 66 [link=http://www.rp.pl/aktyprawne/akty/akt.spr?id=182188]rozporządzenia ministra finansów z 29 czerwca 2006 r. regulującego tryb przekształcania form gospodarki finansowej (DzU nr 116, poz. 783 ze zm.)[/link].
Z rozporządzenia wynika, że likwidacja gospodarstwa pomocniczego mająca na celu przekształcenie go w inną formę polega na zamknięciu rachunku bankowego oraz ustaleniu i przejęciu przez jednostkę budżetową należności, zobowiązań i środków pieniężnych pozostałych na tym rachunku. Nie oznacza końca jego działalności, ponieważ nie dochodzi do zakończenia działalności szkoły.
Zgodnie z [link=http://www.rp.pl/aktyprawne/akty/akt.spr?id=161808]rozporządzeniem ministra edukacji narodowej z 21 maja 2001 r. (DzU. nr 61, poz. 624 ze zm.)[/link] dotyczącym statutów placówek oświatowych statut szkoły publicznej prowadzącej kształcenie zawodowe określa organizację warsztatów szkolnych dla prowadzenia zajęć praktycznych, jeżeli szkoła takie warsztaty posiada. Są one zatem integralną jej częścią.
Jeżeli organ prowadzący szkołę zamierza dokonać likwidacji warsztatów, ma zastosowanie art. 59 ust. 6 [link=http://www.rp.pl/aktyprawne/akty/akt.spr;jsessionid=C5F9A940B34AF3BB764512C011AB09F3?id=175841]ustawy o systemie oświaty[/link]: może to zrobić po zapewnieniu uczniom innego miejsca odbywania zajęć praktycznych (np. w centrum kształcenia praktycznego, u pracodawcy lub w pracowni ćwiczeń praktycznych).
Po przekształceniu formy działalności usługowej lub produkcyjnej prowadzonej przez warsztaty szkół zajmujących się kształceniem zawodowym mogą być zastosowane przepisy ustawy o finansach publicznych dotyczące tzw. rachunków wydzielonych.