Duterte w ostatnim czasie publicznie krytykował sojusz wojskowy Filipin i Stanów Zjednoczonych.
- Najwyższy czas, byśmy polegali na sobie. Wzmocnimy naszą obronę i nie będziemy polegać na żadnym innym kraju - powiedział prezydencki rzecznik Salvador Panelo, cytując Duterte
Prezydent Filipin groził wypowiedzeniem umowy dotyczącej wizyt i ćwiczeń wojsk USA w jego kraju po tym, jak Stany Zjednoczone unieważniły wizę senatorowi Ronaldowi dela Rosa, sojusznikowi Duterte i byłemu szefowi filipińskiej policji, architektowi prowadzonej przez prezydenta wojny z narkotykami.
Pod koniec stycznia Duterte "bezterminowo" zabronił członkom swego rządu i wysokim rangą przedstawicielom państwowej administracji podróżowania do USA.
Filipińsko-amerykańskie porozumienie w sprawie wizyt wojsk USA na Filipinach (Visiting Forces Agreement) zostało przez Manilę ratyfikowane w 1999 r.