Przedawnienie to nadal jeden z najciekawszych tematów związanych z postępowaniami podatkowymi. Od wielu lat toczą się spory podatników z organami podatkowymi na temat wpływu postępowania karnego skarbowego na bieg terminu przedawnienia. Organy podatkowe korzystają z możliwości wszczynania postępowań karnych skarbowych, aby wydłużyć czas na weryfikację rozliczeń podatkowych.
O wpływie postępowania karnego skarbowego na przedawnienie zobowiązań podatkowych wypowiedział się Naczelny Sąd Administracyjny, wydając 24 maja 2021 r. uchwałę (sygn. I FPS 1/21). Potwierdził, że obowiązkiem sądu administracyjnego jest weryfikowanie, czy postępowanie karne skarbowe zostało wszczęte instrumentalnie. Aktualnie spory dotyczą już głównie kryteriów, które powodują, że wszczęcie postępowania karnego skarbowego można uznać za instrumentalne.